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发布日期:2025-12-17 12:15 点击次数:136中青报·中青网记者 邱晨辉
在与害虫的无声较量中,东谈主类正面对着一场前所未有的聪惠博弈。当传统农药厚重失效,绿色防控技巧亟待打破,破译害虫的基因密码成了顺利的关节所在。
高质地的基因组图谱,如合并张“舆图”,为缔造新的绿色防治技能,靶方向精确发现与定位提供了关节教学。但是,若何绘图一张准确、完整的“舆图”?这场关乎生态均衡的攻防战,科研东谈主员找到了破局之谈。
12月3日,中国农业科学院深圳农业基因组磋议所磋议员王桂荣课题组麇集崔鹏课题组在国外学术期刊《当然·通信》上发表磋议论文,磋议以“果蔬杀手”橘小实蝇为磋议对象,顺利构建了在小个体高杂合害虫中最完整的基因组图谱,并在Y染色体区域轻柔味受体基因眷属进行了潜在绿色农药分子靶标挖掘与考据。
橘小实蝇,因其食性杂、寄主广、养殖力强,被称为果蔬界的“头号杀手”。思要“看清”它们,并不是一件容易的事。与大大批农业害虫同样,橘小实蝇的体长仅有8毫米,是典型的小个体农业害虫,小体型决定了其粗俗提供的DNA肇熟察有限,单个橘小实蝇能索求的DNA含量仅有1微克,无法达到传统测序建库至少需要5微克DNA的条目。
“橘小实蝇的基因组高度杂合,这意味着‘舆图’上存在多个高度相似的所在,若何分别并正确标记它们是决定‘舆图’锐利的关节。”王桂荣说。
比年来,科研东谈主员链接发布了多个橘小实蝇基因组版块,但是,这些基因组大多基于夹杂个体拼装,尤其是在中心粒、性染色体这些富含重复的基因序列区域有较多的“盲区”,临了得出的“舆图”并不算竣工。
论文共同第一作家、中国农业科学院深圳农业基因组磋议所副磋议员刘伟说,柬埔寨曝光群理思情况下,从染色体一端的端粒到另一端的端粒应该衔接完整,但此前发布的基因组序列中由于重复DNA序列或未知基因组区域产生了多处空缺。
“这就像一幅关节区域缺失或无极不清的舆图,诚然咱们能看清约莫的抽象分散,但关节的地标信息却丢失了。”刘伟说。
他告诉记者,这些空缺严重边界了咱们对橘小实蝇生物学特色的深远剖判。举例,其重大的环境符合性和抗药性可能就遮掩在这些重复序列组成的“盲区”之中,而缔造高效的绿色防控技巧也艰辛需要一份能明晰标注“关节位置信息”的“完整舆图”。
科研团队提倡了一种新的拼装计谋。他们以单个体雄虫的测序数据动作基本骨架,整合群体测序数据,驾驭不同的测序技巧相互补充。
这是一个不同寻常的吸收。
论文共同第一作家、中国农业科学院深圳农业基因组磋议所副磋议员林强说,在以往的磋议中,由于技巧边界,科研东谈主员经常需要将不同个体虫豸夹杂在沿途,以达到传统测序所需的DNA量。就怕,为了裁减分析难度,会成心吸收遗传布景更浅薄的雌虫。但这就像把好多张相似但不皆备同样的舆图碎屑混在沿途拼图,最终拼出的舆图会充满重复的“重影”,无极不清。
“更要紧的是,这种格式会皆备丢失只好雄虫才领有的Y染色体舆图,而这部分信息关于剖判雄性发育和缔造针对雄虫的防控技巧至关要紧。”林强说。
科研团队在单体雄虫的基础上,顺利拼装出了接近600Mb、中心粒和端粒区域较为完整,并包含性染色体的T2T级别基因组。
与其他橘小实蝇基因组参考版块比较,新的基因组“舆图”初度完了了从端粒到端粒的无缺口完整覆盖,填补了以往基因组中高度重复的复杂区域留住的空缺。
这张高清基因“舆图”给科研团队带来了惊喜发现:橘小实蝇的中心粒区域由3种不同类型的卫星DNA组成,呈现出从中心区向两头异质性厚重递减的分散律例;初度在Y染色体上轻薄到一个在雄虫全组织抒发的ATP合成酶β亚基基因,臆度与雄虫人命行为的高能需求干系;发现了新的气息受体基因。
论文共同通信作家、中国农业科学院深圳农业基因组磋议所磋议员崔鹏说,该磋议挖掘出了Y染色体特异性基因轻柔味受体等潜在的绿色防控技巧靶标大秀直播app软件,为害虫绿色防控技巧的研发与优化提供了高质地参考基因组资源。
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